Após salvarem o Outro Mundo, os heróis finalmente conseguem voltar para seu mundo original, porém, deixando um deles para trás. Quatro anos depois o último herói consegue retornar, carregando consigo muitos segredos. Assim começa uma história de amor e vingança, onde o destino dos dois mundos está em jogo.

Um conto de duas pessoas, Toono Takaki e Shinohara Akari, que eram amigos próximos, mas gradualmente crescem mais e mais longe à medida que o tempo passa. Eles se separam por causa de suas famílias, mas mantém contato através de cartas. Contudo como o tempo continua a passar, eles começam a perder contado um com o outro. Os anos se passam e a distância entre eles fica cada vez maior. No entanto, Takaki se lembra dos tempos que eles passaram juntos, mas como a vida continua a os afastar, ele se pergunta se teria a oportunidade de conhecer Akari novamente.

República de San Magnolia. 

Por muito tempo esse país foi atacado por seu vizinho, o Império, que desenvolveu uma série de veículos militares chamados de Legion, que não possui tripulantes. Em resposta à ameaça iminente, a República conseguiu desenvolver uma tecnologia semelhante e assim devolveu o ataque inimigo, sem fatalidades.

No entanto, essa era apenas a versão oficial. Na verdade, houve sim vítimas. Além dos 85 distritos conhecidos da República, existia um outro. O “não-existente distrito 86”. Foi lá que jovens homens e mulheres do destacamento conhecido como oitenta e seis lutaram... Eles lutam dentro de drones. Shinn comandava as ações dos jovens desse esquadrão suicida enquanto estavam no campo de batalha. E, Lena, uma "Handler", comandava as coisas do lado de fora das batalhas, com a ajuda de um comunicador especial. A história de despedida, cheia de lutas e tristezas desses dois começa!

O Lorde Demônio da Tirania, Arnos, destruiu humanos, espíritos e até mesmo deuses, mas, ao ficar cansado da guerra sem fim, ele sonha com um mundo pacífico em que possa reencarnar. Contudo, infelizmente, 2000 anos no futuro, os seus descendentes tornaram-se fracos graças aos anos de paz, fazendo com que a magia decaísse.

Arnos entra para uma “Academia de Lorde Demônio” dedicada a encontrá-lo: a reencarnação do Lorde Demônio Fundador, mas a academia falha em reconhecer sua força, o rotulando como “desqualificado”.

Em meio aqueles que o subestimaram, em conjunto com a sua única aliada, Misha, o Lorde Demônio desqualificado como Lorde Demônio irá ascender na hierarquia dos seres demoníacos!

Iwatani Naofumi foi invocado para um mundo paralelo junto com 3 outras pessoas para se tornarem os Heróis do Mundo. Cada um dos heróis estavam respectivamente equipados com seu próprio equipamento lendário quando invocados. Naofumi coincidentemente recebeu o Lendário Escudo como sua arma.

Devido à falta de carisma e experiência de Naofumi, ele acabou com uma única companheira no grupo enquanto todos os outros conseguiram vários. Infelizmente, no seu terceiro dia, Naofumi foi traído, falsamente acusado, e roubado pela dita companheira. Odiado por todos do rei aos plebeus, os pensamentos de Naofumi estavam cheios com nada além de vingança e ódio. E, assim, seu destino num mundo paralelo começa…

Num mundo cheio de segredos e profecias sombrias, uma sacerdotisa com sonhos proféticos emerge. Ela tem a missão de encontrar os guardiões de artefatos místicos, capazes de mudar o curso da história.

Acompanhada por aliados improváveis, enfrenta perigos e segredos antigos para deter as forças malignas que buscam realizar as profecias.

Enquanto o tempo urge e a escuridão se espalha, eles lutam para salvar os povos do caos iminente. 
Será que conseguirão vencer as adversidades e evitar a terrível profecia?

Hoshino Kazuki valoriza seu cotidiano acima de tudo. Passa os dias despreocupados com seus amigos na escola, até que a súbita chegada da estudante transferida, Otonashi Aya, quebra a paz e faz uma declaração dramática:

— Estou aqui para quebrar você. Esta é a minha transferência nº 13.118, já perdi minha paciência após tantas iterações. Então, para mudar o ritmo, vou declarar guerra neste momento.

E com essas palavras enigmáticas, os dias normais que Kazuki tanto amam se tornam um ciclo de agitação e medo – após o súbito aparecimento de Aya desenrolam-se mistérios ocultos que cercam os amigos aparentemente normais de Kazuki, incluindo a descoberta das misteriosas “caixas”.

No ano de 2046, a neuro-sincronização, um sistema tecnológico que permite humanos a manipular seus cinco sentidos, já está tão difundida ao ponto onde pessoas possam acessar a internet e entrar em mundos virtuais através de um despositivo conhecido como Neuro-Linker.

Haruyuki é um menino baixo e gordo que tem baixa auto-estima devido ao constante bullying. Um dia, Haru atrai a atenção da vice-presidente do Conselho Estudantil "Kuroyukihime", que oferece para ele o Brain Burst, um programa secreto que permite uma pessoa fazer o tempo parecer parado aos seus arredores por "acelerar" suas ondas cerebrais no mundo real. Infelizmente, há um limite de quantas vezes uma pessoa pode "acelerar" já que isso custa Burst Points, e o jeito principal de conseguir mais pontos é combater e derrotar outros usuários do Brain Burst.

Escola Koudo Ikusei, uma escola de prestígio com instalações de arte onde quase 100% dos alunos vão para a faculdade ou encontram emprego. Os alunos têm a liberdade de usar qualquer penteado e levar todos os itens pessoais que quiserem. A Escola Koudo Ikusei é um paraíso, mas a verdade é que apenas os melhores alunos recebem um tratamento favorável.

O protagonista, Kiyotaka Ayanokouji, é um estudante da Classe D, que é onde a escola descarta os estudantes "inferiores", a fim de ridicularização. Por alguma razão, Kiyotaka estava despreocupado em seu exame de entrada, e foi colocado na Classe D. Após o encontro com Suzune Horikita e Kikyou, outras duas estudantes da sua turma, a situação dele começa a mudar.

Diego Murdock é um garoto assombrado por sonhos estranhos e tios tiranos. Trancafiado em casa, ele explode tudo que consegue tocar.

Após ter mais um sonho acompanhado de um ataque de raiva, ele é enviado pelos tios a uma sede de caçadores de monstros. 

Lá arruma novos problemas com sua ira, inimigos e alguns amigos. Juntos eles descobrem mais sobre si e sobre o mistério que envolve um elixir.